朱元璋登基以后即下令工部在京郊鸡笼山（鸡笼山又名北极阁，位于南京市区，东连九华山，西接鼓楼岗，北近玄武湖，为钟山延伸入城余脉。春秋战国时期，以其山势浑圆，形似鸡笼而得名。鸡笼山高约100米，古时是城中重要制高点。）修建功臣庙祀奉他们的亡灵。从洪武二年诏建功臣庙，到洪武八年（1375年），功臣庙里一共供奉了三百零九位功臣。并从优抚恤他们的亲属，给予一定的官职和俸禄。当时塑像供奉的阵亡武将有：胡大海、赵德胜、华高、俞通海、吴良、曹良臣、吴复、孙兴祖、冯国用、耿再成、丁德兴、张德胜、吴桢、康茂才、茅成等人。以徐达为首的在世功臣则虚位以待。
朱元璋在大封功臣之前，命兵部及大都督府叙报诸将战功及拟议封赏爵禄名单，由他亲自平衡裁定后，于封赏当日由中书省及礼部张榜公布天下，随后制成精致烫金的《大明功臣簿》，以使受赏功臣永远名垂青史。
《大明功臣簿》排序如下：
功臣第一：李善长，晋封韩国公。授开国辅运推诚守正文臣、特进光禄大夫、左柱国、太子太师、中书左丞相。岁禄四千石，予世券。
功臣第二：徐达，晋封魏国公。授奉天开国推诚宣力武臣，特进光禄大夫、左柱国、太子太傅、中书右丞相。岁禄五千石，予世券。
功臣第三：常遇春，殁。谥封开平王，追赠翊运推诚宣德靖远功臣、开府仪同三司、上柱国、太子太保、中书右丞相。子茂袭封郑国公，岁禄二千石，予世券。
功臣第四：李文忠，封鲁国公。授奉天开国辅运推诚宣力武臣，特进荣禄大夫、右柱国、大都督府左都督。岁禄三千石，予世券。
功臣第五：冯胜，封宋国公，授开国辅运推诚宣力武臣、特进荣禄大夫、右柱国。岁禄三千石，予世券。
功臣第六：邓愈，封卫国公，授开国辅运推诚宣力武臣、特进荣禄大夫，右柱国。禄三千石，予世券。
功臣第七：汤和及杨璟、唐胜宗、陆仲亨、周德兴、华云龙、顾时、耿炳文、陈德、郭兴、王志、郑遇春、费聚、吴良、吴桢、赵庸、廖永忠、俞通源、华高、朱亮祖、傅友德、胡美、韩政、黄彬、曹良臣、梅思祖、陆聚、薛显等28人均封侯爵，授开国辅运推诚宣力武臣，岁禄1500石，予世券。
朱元璋对功臣们的封赏是很丰厚的，岁禄公3千石至5千石，侯1500石，而当时正一品的丞相和御史大夫岁禄仅千石以下。当然他们无法和藩王们相比，朱元璋那些儿子们岁禄高达五万石（后减为一万石）。
功臣们还赐给了“丹书铁券”，上面镌刻了他们的功绩和封赏爵禄，背面则为免罪、减禄的条款。以韩国公李善长为例，除叛国谋逆罪外，本人可免两次死罪，子免一次死罪。不过到后来这些免死金牌都不起作用了，上述这班功臣十之八九在胡、蓝党案中惨遭屠戳，能得善终的没有几个。
